مجتمع خراسان از سال 1381 با شروع به کار در شعبه شهید مطهری در ایستگاه راه آهن شهید مطهری تاسیس گردید. هم اکنون این مجتمع وفق قرارداد با گمرک ج.ا.ا در ۱۰ نقطه از گمرکات شرق کشور در سه استان خراسان رضوی، خراسان شمالی و خراسان جنوبی دارای شعب فعال می باشد. این شعب شامل شعبه شهید کاوه مشهد( مستقر در ستاد نظارت گمرکات استان خراسان رضوی)، شعبه شهید مطهری، شعبه شهرک صنعتی خیام نیشابور، شعبه دوغارون، شعبه بیرجند،شعبه ماهیرود، شعبه سرخس، شعبه لطف آباد، شعبه باجگیران و شعبه بجنورد می باشد.
مجتمع خراسان با تامین در اختیار داشتن تجهیزات بروز و کارآمد(شامل 41 دستگاه جرثقیل، 49 دستگاه لیفتراک، ۳ دستگاه تراکتور و سایر تجهیزات تخلیه و بارگیری) و همچنین تعداد 32 انبار مسقف و هانگار به مساحت حدودا 22000 متر مربع و 15 محوطه بارانداز به مساحت حدودا 127000 متر مربع آماده خدمت رسانی به ارباب رجوعان و صاحبین کالا می باشد.
این مجتمع آماده ارائه خدمات در زمینه انبارداری، تخلیه و بارگیری، حفاظت و ایمنی کالا و خدمات جانبی مرتبط از جمله توزین، استریپ و استافینگ کانتینر،ساماندهی ناوگان، صفافی کالاهای خطرناک، بسته بندی و... در رویه های واردات و صادرات کالاهای تجاری به ویژه در مبادی ورودی و خروجی اصلی کشور بوده و افتخار همکاری با تجار و صاحبان کالا، واردکنندگان و صادرکنندگان محترم را داشته است.
همچنین این مجتمع به جهت سهولت در خدمت رسانی و بهبود شرایط فعالیت در استان اقدام به انجام پروژه های عمرانی از جمله ساخت انبار، ساخت سکو تسطیح محوطه های عملیاتی، ساخت ساختمان خدمات رفاهی و ...... در شعبات زیر مجموعه نموده است.